Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PparaP23204 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PparaP23204 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PparaP23204 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PparaP23204 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PparaP23204 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PparaP23204 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PparaP23204 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PparaP23204 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PparaP23204 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PparaP23204 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PparaP23204 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PparaP23204 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PparaP23204 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PparaP23204 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PparaP23204 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PparaP23204 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PparaP23204 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PparaP23204 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PparaP23204 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PparaP23204 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PparaP23204 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PparaP23204 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PparaP23204 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PparaP23204 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PparaP23204 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PparaP23204 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PparaP23204 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PparaP23204 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PparaP23204 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PparaP23204 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PparaP23204 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PparaP23204 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PparaP23204 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PparaP23204 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PparaP23204 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PparaP23204 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PparaP23204 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PparaP23204 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PparaP23204 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms