Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx3P23198 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx3P23198 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms