Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms