Protein–RNA interactions for Protein: P22361

Hnf1a, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf1aP22361 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hnf1aP22361 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf1aP22361 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms