Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klra1P20937 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klra1P20937 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klra1P20937 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klra1P20937 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klra1P20937 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms