Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KitlgP20826 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KitlgP20826 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms