Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csn1s1P19228 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csn1s1P19228 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms