Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18528 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18528 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18528 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18528 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18528 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18528 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18528 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18528 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18528 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms