Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs1P17533 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms