Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptan1P16546 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptan1P16546 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms