Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rag1P15919 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rag1P15919 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rag1P15919 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rag1P15919 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rag1P15919 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rag1P15919 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rag1P15919 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rag1P15919 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rag1P15919 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rag1P15919 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rag1P15919 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rag1P15919 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms