Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb2P13373 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms