Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn1P12960 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn1P12960 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms