Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctla2aP12399 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctla2aP12399 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms