Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Schip1P0DPB4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Schip1P0DPB4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms