Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Amd1P0DMN7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms