Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc9P09633 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc9P09633 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms