Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa9P09631 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa9P09631 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms