Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxb7P09024 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxb7P09024 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms