Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NefmP08553 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NefmP08553 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NefmP08553 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NefmP08553 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NefmP08553 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NefmP08553 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NefmP08553 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NefmP08553 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefmP08553 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefmP08553 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefmP08553 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefmP08553 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NefmP08553 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefmP08553 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefmP08553 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefmP08553 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefmP08553 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefmP08553 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NefmP08553 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NefmP08553 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefmP08553 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefmP08553 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefmP08553 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefmP08553 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefmP08553 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefmP08553 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefmP08553 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefmP08553 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefmP08553 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefmP08553 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NefmP08553 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NefmP08553 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NefmP08553 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NefmP08553 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NefmP08553 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NefmP08553 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NefmP08553 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NefmP08553 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NefmP08553 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NefmP08553 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NefmP08553 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NefmP08553 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NefmP08553 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NefmP08553 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NefmP08553 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NefmP08553 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NefmP08553 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NefmP08553 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NefmP08553 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NefmP08553 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NefmP08553 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NefmP08553 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefmP08553 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NefmP08553 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefmP08553 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefmP08553 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefmP08553 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefmP08553 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefmP08553 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefmP08553 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefmP08553 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefmP08553 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NefmP08553 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NefmP08553 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms