Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna4P07351 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna4P07351 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms