Protein–RNA interactions for Protein: P06799

Ifna7, Interferon alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna7P06799 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna7P06799 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna7P06799 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms