Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06335 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06335 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06335 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06335 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P06335 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06335 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06335 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06335 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06335 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06335 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06335 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06335 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms