Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06323 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P06323 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06323 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06323 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06323 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06323 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms