Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06321 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06321 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06321 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06321 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06321 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06321 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06321 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06321 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06321 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06321 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06321 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06321 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06321 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06321 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
P06321 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06321 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06321 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06321 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms