Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CrygdP04342 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrygdP04342 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms