Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a1P02463 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a1P02463 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms