Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01797 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01797 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01797 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01797 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01797 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01797 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01797 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01797 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01797 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01797 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01797 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01797 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01797 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms