Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01790 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01790 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01790 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01790 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01790 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01790 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01790 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01790 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01790 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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P01790 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01790 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01790 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01790 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01790 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01790 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01790 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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