Protein–RNA interactions for Protein: P01726

Ig lambda-1 chain V region H2020, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01726 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01726 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01726 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01726 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
P01726 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01726 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01726 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01726 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01726 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01726 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01726 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01726 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01726 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01726 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01726 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01726 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01726 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01726 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01726 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01726 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01726 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01726 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01726 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01726 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01726 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01726 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01726 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P01726 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01726 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01726 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01726 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01726 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01726 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01726 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01726 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01726 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms