Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01663 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01663 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01663 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01663 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01663 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01663 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01663 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01663 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01663 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01663 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01663 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01663 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01663 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01663 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01663 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01663 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01663 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01663 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01663 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01663 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01663 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01663 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01663 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01663 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01663 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01663 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01663 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01663 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01663 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01663 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01663 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01663 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01663 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01663 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01663 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01663 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms