Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01655 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01655 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01655 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01655 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01655 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01655 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01655 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01655 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01655 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01655 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01655 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01655 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01655 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01655 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01655 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01655 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01655 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01655 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01655 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01655 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms