Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01649 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01649 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01649 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01649 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01649 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01649 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01649 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01649 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01649 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01649 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01649 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01649 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01649 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01649 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01649 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01649 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms