Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo1O89026 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo1O89026 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo1O89026 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo1O89026 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo1O89026 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo1O89026 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo1O89026 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo1O89026 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Robo1O89026 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Robo1O89026 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Robo1O89026 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Robo1O89026 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Robo1O89026 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms