Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb2O88838 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spsb2O88838 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms