Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops3O88543 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops3O88543 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops3O88543 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops3O88543 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops3O88543 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms