Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nid2O88322 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nid2O88322 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nid2O88322 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nid2O88322 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nid2O88322 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms