Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntsr1O88319 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms