Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrna4O70174 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrna4O70174 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms