Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb5O55234 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb5O55234 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms