Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChadO55226 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChadO55226 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChadO55226 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChadO55226 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChadO55226 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChadO55226 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChadO55226 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChadO55226 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChadO55226 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChadO55226 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChadO55226 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChadO55226 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChadO55226 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChadO55226 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChadO55226 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChadO55226 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChadO55226 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChadO55226 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChadO55226 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChadO55226 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChadO55226 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChadO55226 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChadO55226 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChadO55226 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChadO55226 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChadO55226 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChadO55226 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChadO55226 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChadO55226 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChadO55226 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChadO55226 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChadO55226 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChadO55226 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ChadO55226 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms