Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sept7O55131 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sept7O55131 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sept7O55131 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sept7O55131 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sept7O55131 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Sept7O55131 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Sept7O55131 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Sept7O55131 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Sept7O55131 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
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Sept7O55131 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Sept7O55131 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Sept7O55131 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Sept7O55131 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sept7O55131 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms