Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26a1O55127 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp26a1O55127 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms