Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg2O55111 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg2O55111 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms