Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3O55013 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3O55013 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms