Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Socs5O54928 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Socs5O54928 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Socs5O54928 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Socs5O54928 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms