Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EdaO54693 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EdaO54693 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EdaO54693 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EdaO54693 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EdaO54693 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EdaO54693 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EdaO54693 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EdaO54693 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EdaO54693 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EdaO54693 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EdaO54693 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EdaO54693 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EdaO54693 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EdaO54693 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EdaO54693 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EdaO54693 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EdaO54693 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EdaO54693 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EdaO54693 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EdaO54693 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EdaO54693 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EdaO54693 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EdaO54693 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EdaO54693 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EdaO54693 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EdaO54693 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EdaO54693 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EdaO54693 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EdaO54693 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EdaO54693 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EdaO54693 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EdaO54693 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EdaO54693 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EdaO54693 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EdaO54693 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EdaO54693 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EdaO54693 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EdaO54693 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EdaO54693 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EdaO54693 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EdaO54693 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EdaO54693 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EdaO54693 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms