Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2AO43633 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP2AO43633 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms