Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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FxnO35943 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FxnO35943 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FxnO35943 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FxnO35943 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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FxnO35943 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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FxnO35943 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FxnO35943 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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FxnO35943 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FxnO35943 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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FxnO35943 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FxnO35943 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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FxnO35943 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FxnO35943 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FxnO35943 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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FxnO35943 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FxnO35943 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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FxnO35943 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FxnO35943 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FxnO35943 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FxnO35943 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FxnO35943 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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FxnO35943 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FxnO35943 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FxnO35943 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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FxnO35943 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms