Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timm44O35857 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Timm44O35857 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Timm44O35857 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms